Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии) [Решено]
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии) [Решено]
С наступающим, наступившим (у кого наступил) новым годом!
У меня установлен Rosa_mate_R11
Мне сделали снимок КТ аппаратом Planmeca ProMaxx. Несколько врачей, в разных городах, пытались открыть dicom файл. У них у всех был установлен windows и появлялось сообщение, о повреждении файла.
У себя на Rosa установил много бесплатных программ, для просмотра снимков компьютерной томографии. Все программы или открыли в срезе axial, или вообще ни чего не показали.
Только программа Weasis показала в двух срезах:
Axial, Coronal.
Sagittal не открыл.
Загрузил файл в программу:
File → Open Dicom → выбрал файл.
2D Viewer → Open in new tab → MPR
Оперативная память, во время загрузки файла, используется 7.7 Гб. После загрузки, при просмотре снимков 5.7 Гб.
Пожелание к разработчикам Rosa:
сделайте так, чтобы в трёх срезах показывала.
У меня установлен Rosa_mate_R11
Мне сделали снимок КТ аппаратом Planmeca ProMaxx. Несколько врачей, в разных городах, пытались открыть dicom файл. У них у всех был установлен windows и появлялось сообщение, о повреждении файла.
У себя на Rosa установил много бесплатных программ, для просмотра снимков компьютерной томографии. Все программы или открыли в срезе axial, или вообще ни чего не показали.
Только программа Weasis показала в двух срезах:
Axial, Coronal.
Sagittal не открыл.
Загрузил файл в программу:
File → Open Dicom → выбрал файл.
2D Viewer → Open in new tab → MPR
Оперативная память, во время загрузки файла, используется 7.7 Гб. После загрузки, при просмотре снимков 5.7 Гб.
Пожелание к разработчикам Rosa:
сделайте так, чтобы в трёх срезах показывала.
Последний раз редактировалось Артур_М 15 янв 2024, 08:35, всего редактировалось 4 раза.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
А разработчики Роса причем? Обращайтесь к разработчикам программы в которой хотите видеть поддержку этих осей
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
В Rosa должна быть хотя бы одна программа, показывающая в трёх срезах, для того, чтобы ею пользовались, при просмотре Dicom файлов.
Эта статья не только пожелания к разработчикам, но и руководство для тех, кто не может посмотреть снимки КТ на windows
- VictorR2007
- Сообщения: 7317
- Зарегистрирован: 12 сен 2011, 13:00
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
А онлайн просмотрщики DICOM Viewer не открывают?
https://www.imaios.com/ru/resursy/blog/ ... com-viewer
https://www.imaios.com/ru/resursy/blog/ ... com-viewer
- VictorR2007
- Сообщения: 7317
- Зарегистрирован: 12 сен 2011, 13:00
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
А что, у других есть?
Они существуют для Линукс?
Или вы имеете ввиду, что Роса должна нанять программистов, чтобы они написали программу, и добавить её в репы?
Как-то непонятно, что вы имеете ввиду под «Должна».
Если есть ссылка на такую программу для Линукс, дайте ссылку,
и если у ней лицензия позволяет, можно добавить в репы.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
DICOM Library - на сайте https://www.dicomlibrary.com/ написано "Softneta прекратила поставки в Россию и Беларусь"VictorR2007 писал(а): ↑31 дек 2023, 20:16А онлайн просмотрщики DICOM Viewer не открывают?
https://www.imaios.com/ru/resursy/blog/ ... com-viewer
post Dicom - для 14 дневного бесплатного пользования.
IMAIOS DICOM Viewer - не загружает мой файл с облака.
Voxelx для 15 дневного бесплатного пользования.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
"А что, у других есть?
Они существуют для Линукс?"
Для ubuntu есть несколько.
"Или вы имеете ввиду, что Роса должна нанять программистов, чтобы они написали программу, и добавить её в репы?
Как-то непонятно, что вы имеете ввиду под «Должна»."
Мне, как пользователю, Rosa ничего не должна.
"Если есть ссылка на такую программу для Линукс, дайте ссылку,
и если у ней лицензия позволяет, можно добавить в репы."
Ищу в интернете такую работающую программу под Rosa. Нашёл только Weasis
https://weasis.org/en/getting-started/d ... m-viewer/
Они существуют для Линукс?"
Для ubuntu есть несколько.
"Или вы имеете ввиду, что Роса должна нанять программистов, чтобы они написали программу, и добавить её в репы?
Как-то непонятно, что вы имеете ввиду под «Должна»."
Мне, как пользователю, Rosa ничего не должна.
"Если есть ссылка на такую программу для Линукс, дайте ссылку,
и если у ней лицензия позволяет, можно добавить в репы."
Ищу в интернете такую работающую программу под Rosa. Нашёл только Weasis
https://weasis.org/en/getting-started/d ... m-viewer/
- VictorR2007
- Сообщения: 7317
- Зарегистрирован: 12 сен 2011, 13:00
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Вы можете цитировать не копируя текст.
Показал на рисунке.
Процитировали и ответили, потом выделили следующий текст для цитирования.
И т.д.
Показал на рисунке.
Процитировали и ответили, потом выделили следующий текст для цитирования.
И т.д.
- VictorR2007
- Сообщения: 7317
- Зарегистрирован: 12 сен 2011, 13:00
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Вас остановила такая мелочь?Артур_М писал(а): ↑31 дек 2023, 20:52DICOM Library - на сайте https://www.dicomlibrary.com/ написано "Softneta прекратила поставки в Россию и Беларусь"
Как раз для решения таких проблем используется Tor-Browser https://tor-browser.ru/
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Параллельно с Росой использую Ubuntu - нашёл под неё только программу Weasis, но она позовляет только "поштучно" просматривать файлы DICOM, не позволяя сделать их плавную прокрутку.
AMD FX-8350/ASUS SABERTOOTH 990FX/ASUS GTX-950/8 Gb RAM
"Боинг... [CENSORED], не летит... то ли шимпанзе, которую посадили за штурвал не выспалась, то ли гориллу надо было сажать. Но нет... это что-то с Боингом не так..." (с)
"Боинг... [CENSORED], не летит... то ли шимпанзе, которую посадили за штурвал не выспалась, то ли гориллу надо было сажать. Но нет... это что-то с Боингом не так..." (с)
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Здравствуй Sartorius.Параллельно с Росой использую Ubuntu - нашёл под неё только программу Weasis, но она позовляет только "поштучно" просматривать файлы DICOM, не позволяя сделать их плавную прокрутку.
Я тоже параллельно использую ubuntu mate 16.04. У меня работают две программы для просмотра dicom файлов:
- Weasis
- MRview
Можно смотреть на экране по очереди в трёх срезах: Axial, Coronal, Sagittal. Преимущество в том, что потребляет примерно 3.5 Гб оперативной памяти. С процессором двух ядерным, с кэш памятью 2мб - работает быстро. В Роса не устанавливается.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Артур_М, В репозитории ROSA есть:
Amide - кроссплатформенный GTK+ инструмент для просмотра, регистрации и анализа объемных наборов данных медицинской визуализации (только он не запускается, пишет в терминале "стёк памяти сброшен". Попросите починить, она есть и в ALT Linux),
XMedcon - это инструментарий и библиотека с открытым исходным кодом для преобразования медицинских изображений, разработанная в основном для преобразования реконструированных ядерных медицинских изображений. (ярлык не создаётся, запуск через usr/bin),
Aeskulap — это программа просмотра медицинских изображений, созданная как альтернатива коммерческим программам просмотра DICOM с открытым исходным кодом и основанная на glademm, gtkmm и gconfmm (известный).
Может есть ещё что-то https://yandex.ru/search/?text=mrviewer ... 87&win=623
Онлайн просмотрщик DICOM Viewer https://www.dicomlibrary.com/ работает.
Amide - кроссплатформенный GTK+ инструмент для просмотра, регистрации и анализа объемных наборов данных медицинской визуализации (только он не запускается, пишет в терминале "стёк памяти сброшен". Попросите починить, она есть и в ALT Linux),
XMedcon - это инструментарий и библиотека с открытым исходным кодом для преобразования медицинских изображений, разработанная в основном для преобразования реконструированных ядерных медицинских изображений. (ярлык не создаётся, запуск через usr/bin),
Aeskulap — это программа просмотра медицинских изображений, созданная как альтернатива коммерческим программам просмотра DICOM с открытым исходным кодом и основанная на glademm, gtkmm и gconfmm (известный).
Может есть ещё что-то https://yandex.ru/search/?text=mrviewer ... 87&win=623
Онлайн просмотрщик DICOM Viewer https://www.dicomlibrary.com/ работает.
Последний раз редактировалось turik02 02 янв 2024, 22:03, всего редактировалось 3 раза.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Артур_М, А Weasis можно поставить через flathub https://flathub.org/apps/io.github.nroduit.Weasis
(Для смены языка программы выберите пункт меню «File» - «Preferences...», в открывшемся окне настроек откройте пункт General – Language и выберите из списка необходимый язык). (Работает в Xorg).
sudo dnf install flatpak
flatpak install https://dl.flathub.org/repo/appstream/i ... flatpakref
и перезагрузка
Ещё есть в shap https://snapcraft.io/jimbodicomviewer
(Для смены языка программы выберите пункт меню «File» - «Preferences...», в открывшемся окне настроек откройте пункт General – Language и выберите из списка необходимый язык). (Работает в Xorg).
sudo dnf install flatpak
flatpak install https://dl.flathub.org/repo/appstream/i ... flatpakref
и перезагрузка
Ещё есть в shap https://snapcraft.io/jimbodicomviewer
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Вы имеете ввиду единичный файл, а я подразумеваю серию томограмм, размещённых в одной папке (директории).
AMD FX-8350/ASUS SABERTOOTH 990FX/ASUS GTX-950/8 Gb RAM
"Боинг... [CENSORED], не летит... то ли шимпанзе, которую посадили за штурвал не выспалась, то ли гориллу надо было сажать. Но нет... это что-то с Боингом не так..." (с)
"Боинг... [CENSORED], не летит... то ли шимпанзе, которую посадили за штурвал не выспалась, то ли гориллу надо было сажать. Но нет... это что-то с Боингом не так..." (с)
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Здравствуй turik02turik02 писал(а): ↑02 янв 2024, 13:36Артур_М, В репозитории ROSA есть:
Amide - кроссплатформенный GTK+ инструмент для просмотра, регистрации и анализа объемных наборов данных медицинской визуализации (только он не запускается, пишет в терминале "стёк памяти сброшен". Попросите починить, она есть и в ALT Linux),
XMedcon - это инструментарий и библиотека с открытым исходным кодом для преобразования медицинских изображений, разработанная в основном для преобразования реконструированных ядерных медицинских изображений. (ярлык не создаётся, запуск через usr/bin),
Aeskulap — это программа просмотра медицинских изображений, созданная как альтернатива коммерческим программам просмотра DICOM с открытым исходным кодом и основанная на glademm, gtkmm и gconfmm (известный).
Может есть ещё что-то https://yandex.ru/search/?text=mrviewer ... 87&win=623
Онлайн просмотрщик DICOM Viewer https://www.dicomlibrary.com/ работает.
- Amide - не видит мой dicom файл.
- XMedcon запустил из usr/bin, не видит мой dicom файл.
- Aeskulap - открывает файл, но можно смотреть только Axial срез.
- MRview - есть только deb пакет. Попробую позже преобразовать в rpm.
- https://www.dicomlibrary.com/ для просмотра нужно загрузить мой файл на их сервер, а он весит 2гб. Сейчас не могу проверить работает ли на их сайте, так как у меня нет столько мегабайтов.
Последний раз редактировалось Артур_М 07 янв 2024, 03:38, всего редактировалось 1 раз.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Артур_М, Вот ещё aliza https://flathub.org/apps/com.github.Ali ... ng.AlizaMS
А MRview что ли это https://disk.yandex.ru/d/DS_DQSfHRB7G5g
А MRview что ли это https://disk.yandex.ru/d/DS_DQSfHRB7G5g
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
mrview3 собрал для платформы 2021.1 и 2023.1
2016.1 уже не поддерживаем.
2016.1 уже не поддерживаем.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
А ссылочку можно? Или она уже добавлена в "репы"?
AMD FX-8350/ASUS SABERTOOTH 990FX/ASUS GTX-950/8 Gb RAM
"Боинг... [CENSORED], не летит... то ли шимпанзе, которую посадили за штурвал не выспалась, то ли гориллу надо было сажать. Но нет... это что-то с Боингом не так..." (с)
"Боинг... [CENSORED], не летит... то ли шимпанзе, которую посадили за штурвал не выспалась, то ли гориллу надо было сажать. Но нет... это что-то с Боингом не так..." (с)
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Sartorius, Уже в репах. Имя
mrtrix3 (версия 3.0.4)
У меня платформа 2021.1. Конфликтует с cdrkit-genisoimage .Удалил его и mrtrix3 установился.
mrtrix3 (версия 3.0.4)
У меня платформа 2021.1. Конфликтует с cdrkit-genisoimage .Удалил его и mrtrix3 установился.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Да конфликт есть, но прога собирается нестандартно и я пока не придумал как разрулить конфликт. Сами разработчики пишут что типа ставьте из архива, а потом каталог в котором программа добавляйте в PATH.
Upd. Конфликт пофиксили, должно ставится нормально
Upd. Конфликт пофиксили, должно ставится нормально
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
turik02 установил через flatpakturik02 писал(а): ↑02 янв 2024, 14:34Сообщение turik02 » 02 янв 2024, 14:34
Артур_М, А Weasis можно поставить через flathub https://flathub.org/apps/io.github.nroduit.Weasis
(Для смены языка программы выберите пункт меню «File» - «Preferences...», в открывшемся окне настроек откройте пункт General – Language и выберите из списка необходимый язык). (Работает в Xorg).
sudo dnf install flatpak
flatpak install https://dl.flathub.org/repo/appstream/i ... flatpakref
и перезагрузка
Ещё есть в shap https://snapcraft.io/jimbodicomviewer
flatpak install flathub io.github.nroduit.Weasis
Перегрузил компьютер.
Без изменений. Sagittal срез не открыл.
Программа jimbodicomviewer. Для скачивания, только deb пакеты, rpm - нет.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Непрочитанное сообщение turik02 » 07 янв 2024, 12:14
Артур_М, Попробуй https://disk.yandex.ru/d/DS_DQSfHRB7G5g
Последний раз редактировалось Артур_М 07 янв 2024, 13:59, всего редактировалось 1 раз.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Артур_М, Вот из репы ROSA2021.1 https://disk.yandex.ru/d/JaJGM-kG4TUovA
Если не установится RPM, то надо переустанавливать ОС. Уже готовится 2023.1
Если не установится RPM, то надо переустанавливать ОС. Уже готовится 2023.1
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Нужно удалить зависимости, которые мне нужны, для работы других программ.Артур_М, Вот из репы ROSA2021.1 https://disk.yandex.ru/d/JaJGM-kG4TUovA
Можно в Роса обновить платформу с 2016 до 2021?
В ubuntu например, можно обновить. При этом не нужно повторно устанавливать, установленные программы и настройки.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
2016 до 2021 обновить нельзя. Только переустановка.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
На официальном сайте загрузки нет Роса mate 12 платформы.
А тут есть. Это официальный сайт?
Код: Выделить всё
https://rosa.ru/rosa-linux-download-links/
А тут
Код: Выделить всё
https://abf.rosalinux.ru/platforms/rosa2021.1/products/317
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
официально mate не выпускается.
это сайт сборочной системы, просто кто-то сделал сборку с mate на основе репозитария Роса
зы. Если разговор сменился на "где взять сборки" то лучше отдельной темой в соответствующем разделе.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Артур_М, Наверное лучше будет сборка ROSA mate 13 платформы уже https://abf.io/platforms/rosa2023.1/products/417
А почему именно mate? Чем плохи другие, если нужна легковеска, то можно выбрать LXQT или XFCE.
Можно скачать образ с оф. сайта, сделать флешку загрузочной, запустить и выбрать LIVE. И сможете ознакомиться с системой перед установкой.
А почему именно mate? Чем плохи другие, если нужна легковеска, то можно выбрать LXQT или XFCE.
Можно скачать образ с оф. сайта, сделать флешку загрузочной, запустить и выбрать LIVE. И сможете ознакомиться с системой перед установкой.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
irton, спасибо за ссылку 13 платформы, но я уже скачал 12 платформу. Вообще меняю платформу, что бы работала программа mrtrix3 и Weasis.
Когда перестала поддержка Gnome2, я перешёл на рабочую среду mate.
Потому, что её можно настроить, что бы стала похожей на ubuntu 10.04 c рабочей средой Gnome2. Для меня это самая понятная рабочая среда и легковесная.А почему именно mate?
Когда перестала поддержка Gnome2, я перешёл на рабочую среду mate.
Просмотр Dicom файлов (снимки компьютерной томографии)
Скачал здесьhttps://abf.io/platforms/rosa2023.1/pro ... ists/49520turik02 » 10 янв 2024, 03:17
Артур_М, Наверное лучше будет сборка ROSA mate 13 платформы уже https://abf.io/platforms/rosa2023.1/products/417
Устанавливается, только с консоли.
Скачал ROSA_2021.1_MATE_x86_64 здесь https://abf.rosalinux.ru/platforms/ros ... sts/49532
и установил
Программа mrtrix3 установилась и работает. Одновременно можно снимки смотреть в трёх срезах.
Проблема решена.
Спасибо.